上海留学生落户补充协议是留学生与用人单位、或用人单位与相关机构之间，为明确留学生办理上海常住户口过程中各方权利义务而签署的附加协议。该协议通常作为劳动合同或服务协议的补充，主要针对落户服务期内的责任、违约条款、服务期限、档案管理等内容进行细化。

补充协议一般包括以下内容：一是明确落户申请由用人单位协助办理，单位承诺提供必要材料并配合相关部门审核；二是约定落户成功后，员工需在单位继续服务一定年限（通常为2-3年），若提前离职需承担相应违约责任；三是规定违约金金额或赔偿方式，如退还单位承担的落户相关费用、支付违约金等，但金额需符合《劳动合同法》相关规定，通常不超过实际损失；四是明确员工在落户过程中应如实提供个人信息和材料，若因材料虚假导致落户失败或被撤销，责任由员工自行承担；五是涉及档案调转、社保缴纳、居住证衔接等操作性事项的安排。

需注意，补充协议不得违反法律法规强制性规定，尤其不能限制人身自由或设定过高违约金。根据上海市人社局相关政策，用人单位不得以落户为由收取押金或设置不平等条款。协议应在双方自愿、平等基础上签订，建议签署前仔细阅读条款，必要时咨询法律专业人士或上海市人才服务中心。

此外，随着政策动态调整，如2022年起上海对世界排名前50院校留学生取消社保和工作年限要求，补充协议也应结合最新政策制定，确保合法合规。总之，该协议旨在保障双方权益，促进留学生顺利落户并稳定就业。