留学生在上海申请落户时，个人所得税申报是重要环节之一，直接关系到落户资格的审核。根据上海市现行的留学回国人员落户政策，个税缴纳情况需与劳动合同、社保记录保持一致，体现真实、连续的就业和纳税行为。

首先，留学生需与上海用人单位签订劳动合同，并由单位为其缴纳社会保险和申报个人所得税。个税申报主体应为在上海注册的用人单位，且申报金额需与实际收入相符，不得通过异地或第三方公司代缴。税务部门会核查个税缴纳记录是否连续、足额，是否存在补缴或断缴情况。

其次，个税申报时间应与社保缴纳时间匹配。通常要求申请人在申请落户前，在上海连续缴纳个税和社保满6个月或12个月（视具体落户通道而定），且个税申报状态正常。例如，通过“单位直接申请”通道的高层次留学人员，一般要求最近6个月个税与社保一致；而通过“重点机构”引进的，则可能要求更长时间的稳定纳税记录。

此外，个税申报收入应与劳动合同约定薪酬基本相符，避免明显偏低或频繁零申报。税务系统数据将与人社、社保系统联网核查，若发现个税申报金额远低于社保缴费基数，可能被认定为虚假申报，影响落户审核。

对于自主创业的留学人员，需以公司法人或股东身份依法申报经营所得个税，同时缴纳相应社保，纳税记录需体现企业正常运营。

建议留学生落户前通过“个人所得税APP”或“上海市电子税务局”查询并打印个税缴纳记录，确保信息准确无误。如有漏报、错报，应及时联系单位财务补正。税务合规是落户审核的关键环节，务必重视。

总之，留学生在上海落户，个税申报必须真实、连续、足额，并与社保、劳动合同保持一致，确保通过多部门联合审核。