南通ODI（境外直接投资）备案是指南通市企业或个人在向境外投资时，依法向相关主管部门申请备案的流程。该备案是国家对外投资监管的重要环节，主要涉及商务部门、外汇管理部门及发改委三个系统。

首先，企业需在江苏省商务厅或南通市商务局进行境外投资备案。准备材料包括：公司营业执照、董事会决议、境外投资申请表、投资协议、境外企业注册文件等。通过“商务部业务系统统一平台”在线提交，审核通过后取得《企业境外投资证书》。

其次，向南通市发展和改革委员会或江苏省发改委申报项目备案。需提交项目情况说明、投资资金来源证明、尽职调查报告等。发改部门主要审查投资项目的合规性与真实性，通过后出具《境外投资项目备案通知书》。

最后，完成外汇登记。企业持商务和发改的备案文件，到注册地银行或国家外汇管理局南通市中心支局办理ODI外汇登记，开立境外投资专用账户，实现资金合规出境。

整个流程通常需20-30个工作日，具体时间视材料完整性和审批效率而定。特别注意：投资领域若涉及敏感国家、行业（如军工、媒体等），可能需核准而非备案，审批更严格。

建议企业在备案前咨询专业机构，确保材料合规，避免因信息不全或政策理解偏差导致延误。同时，完成备案后需按要求报送境外投资年报，履行后续监管义务。

总之，南通企业办理ODI备案需统筹商务、发改、外汇三部门要求，依法合规推进，有助于保障境外投资顺利实施，防范政策与金融风险。