跨境电商企业进行境外直接投资（ODI，Overseas Direct Investment）备案，是指境内企业通过设立、并购等方式在境外拥有非金融类企业或项目并取得所有权、控制权等权益时，需向中国相关主管部门履行的审批或备案程序。该流程主要涉及商务部门、发改委及外汇管理局三方面。

首先，企业需向注册地商务部门申请《企业境外投资证书》。提交材料包括境外投资备案表、企业营业执照、对外投资决议、境外企业章程或协议草案等。若投资金额超过一定限额（如中方投资额3亿美元以上），或涉及敏感国家、行业，则需报商务部核准。

其次，向发改委备案或核准。根据《企业境外投资管理办法》，非敏感类项目且中方投资额在3亿美元以下的，实行备案管理；超过3亿美元或涉及敏感领域的，需发改委核准。需提交项目申请报告、投资协议、资金来源证明等材料。

最后，完成外汇登记。企业凭商务部门颁发的《境外投资证书》和发改委的备案/核准文件，到银行办理外汇登记（ODI外汇登记），开立境外投资专用账户，合规汇出投资资金。

跨境电商企业常见ODI用途包括设立海外仓、注册境外子公司、搭建本地电商平台等。合规完成ODI备案有助于资金合法出境、保障境外资产权益、提升融资能力，并避免后续税务、审计风险。

注意事项：企业应确保投资真实合规，资金用途与申报一致；及时完成国家外汇管理局的存量权益登记；关注投资目的地的外资准入政策，避免违反双边协定或制裁规定。

总之，跨境电商企业开展ODI需提前规划，按“商务+发改+外汇”三步流程依法备案，确保跨境投资合法、资金通道顺畅，为全球化布局奠定合规基础。